Zatoka Pomorska leży w południowej części Bałtyku i ma łatwiejszą wymianę wód z Morzem Północnym, a tym samym zasolenie wody osiąga około 7‰, natomiast Zatoka Botnicka jest najbardziej oddalona od cieśnin duńskich, a dodatkowo leży w strefie klimatu subpolarnego i umiarkowanego chłodnego – około 1,5‰.
