Większość bakterii odżywia się cudzożywnie:
● bakterie pasożytnicze, które czerpią pokarm od innych organizmów, powodując u nich ciężkie choroby,
● bakterie symbiotyczne żyjące wewnątrz lub na powierzchni innego organizmu, gdzie oba organizmy odnoszą korzyść ze współdziałania, korzystając z wzajemnie wytwarzanych substancji,
● bakterie gnilne, które odżywiają się martwą materią.
Nieliczne bakterie odżywiają się autotroficznie:
● bakterie fotosyntetyzujące,
● bakterie chemosyntetyzujące, które czerpią energię z utleniania związków nieorganicznych.