Gatunki wskaźnikowe (bioindykatory) wykorzystujemy do oceny stanu wód, gleby, powietrza oraz oznaczania miejsc występowania złóż określonych minerałów, a nawet typów gleby.
Ocena stanu wód – wykorzystuje się małże (wykorzystywane np. w oczyszczalniach ścieków), ponieważ otwierają swoje muszle, tylko w wodach czystych; gdy pojawia się zanieczyszczenie zamykają swoje muszle.
Ocena stanu gleby – Szałwia łąkowa preferuje stanowiska bogate w wapń. Koniczyna biała występuje na glebach bogatych w fosfor, a na duża zawartość azotu wskazuje obecność pokrzywy zwyczajnej.
Ocena stanu powietrza – porosty o plesze listkowatej występują w środowisku o stężeniu tlenku siarki(IV) mieszczącym się w przedziale 50 – 70 μg/m3.