Przyczyną niskiej różnorodności dzisiejszej populacji żubrów nizinnych jest wybranie tylko kilku osobników trzymanych w niewoli do odtworzenia populacji tego gatunku.
Różnorodność genetyczna opiera się na występowaniu różnych alleli wśród osobników danego gatunku w populacji. Ponieważ populację odtworzono tylko z kilku osobników tego gatunku żubra, nie stworzono populacji o dużej ilości alleli. Stąd jest to przyczyną niskiej różnorodności genetycznej żubrów nizinnych.