Gruczoły endokrynne wydzielają hormony bezpośrednio do krwi, natomiast gruczoły egzokrynne wydzielają swoje produkty na zewnątrz organizmu lub do przewodu pokarmowego.
| Gruczoły endokrynne | Gruczoły egzokrynne |
| Wydzielają hormony do krwi. | Wydzielają produkty na zewnątrz organizmu lub do przewodu pokarmowego. |
| Brak przewodów wyprowadzających. | Posiadają przewody wyprowadzające. |
| Ich produkty działają na odległe narządy i komórki organizmu. | Ich produkty działają lokalnie na tkanki lub są transportowane wraz z wydzielanymi substancjami. |
| Przykłady: przysadka mózgowa, tarczyca, nadnercza. | Przykłady: ślinianki, trzustka, wątroba. |
Różnica wynika z różnej funkcji tych gruczołów i sposobu, w jaki ich wydzielane substancje mają oddziaływanie na organizm. Gruczoły endokrynne odgrywają rolę w regulacji i koordynacji procesów metabolicznych i fizjologicznych, podczas gdy gruczoły egzokrynne dostarczają produkty do miejsc docelowych w organizmie lub do przewodu pokarmowego, gdzie odgrywają rolę w trawieniu i wydalaniu substancji.