Szczepienia pozwalają wyeliminować choroby dotykające duże grupy osób i zapobiec ich rozprzestrzenianiu się. Dzieje się tak dlatego, że podczas szczepienia organizm ulega immunizacji, czyli zostają wytworzone przeciwciała przeciwko antygenom wirusa, które pozwalają na przygotowanie się organizmu na kolejną infekcję, przez co możliwe jest bardzo szybkie zwalczenie i eliminacja patogenu. Pozwala to na uniknięcie choroby, czyli stanie się na nią odpornym.
Przez szczepienie wprowadzane są do organizmu unieszkodliwione patogeny, których antygeny mogą być rozpoznane przez limfocyty i zapamiętane, na wypadek przyszłego ich wystąpienia organizmie. Dzięki temu w momencie infekcji spowodowanej przez dany patogen, organizm jest dużo szybciej w stanie uruchomić mechanizmy obronne i go zwalczyć. Taka odporność to przykład odporności sztucznej czynnej, gdyż mimo otrzymania patogenu w wyniku zabiegu medycznego, organizm sam musi przygotować się do odpowiedzi na niego.