Wody te nie nadają się do celów rolniczych ze względu na dużą zawartość substancji gnilnych oraz bakterii.
Pomimo dużych zasobów wód na terenie Kotliny Biebrzy, nie mogą zostać one użyte w rolnictwie. Występuje w nich wiele zanieczyszczeń, które negatywnie wpływałyby na uprawy, prowadząc do ich zniszczenia.