Muszka owocowa jest dobrym organizmem modelowym, ponieważ:
1. szybko się rozmnaża – umożliwia to uzyskanie dużej ilości potomstwa, w krótkim czasie
2. ma optymalny rozmiar – jest na tyle duża, że łatwo obserwować u niej zmiany takie jak kolor oczu czy zmiany kształtu skrzydeł. Jednocześnie jej rozmiary nie sprawiają trudności w hodowli i utrzymaniu
3. posiada jedynie 4 chromosomy – ułatwia to badanie mechanizmów dziedziczenia, zawęża pole badań do niewielkiej liczby chromosomów
4. samce są łatwo odróżnialne od samic.
