Próbę kontrolną stanowiły siewki rzodkiewnika pospolitego hodowane przez taki sam czas i w takich samych warunkach jak pozostałe siewki, ale niepoddawane działaniu żadnej z badanych auksyn.
Próba kontrolna różni się od badawczych brakiem badanego czynnika, czyli auksyny. Dzięki temu można stwierdzić, czy obserwowane różnice rzeczywiście są skutkiem działania zastosowanych fitohormonów.