Izolacja geograficzna ma bardzo duży wpływ na powstawanie nowych gatunków, ponieważ rozdziela pierwotną populację, która ma uniemożliwiony kontakt ze sobą, więc nie mogą się swobodnie krzyżować. Zahamowana wymiana informacji genetycznej połączona ze stopniową adaptacją do nowych warunków środowiska powoduje dalszą specjację i powstawanie nowych gatunków.
Przykładem izolacji geograficznej jest wystąpienie trzęsienia ziemi i rozdzielenia się populacji na dwie osobne płyty tektoniczne.