Pierwiastkami tymi są m.in.:
wodór – H
tlen – O
azot – N
siarka – S
fosfor - P
W skład związków organicznych może wchodzić bardzo duża liczba pierwiastków. Powyżej zostały wymienione tylko niektóre. Wodór oczywiście jest najbardziej podstawowym z nich, ponieważ to on wraz z węglem tworzy złożone struktury węglowodorowe. W skład związków organicznych mogą wchodzić także inne niemetale, na przykład chlor, brom, jod, fluor, selen; a nawet metale – w związkach metaloorganicznych, np. magnez, lit, miedź.