okular – powiększa oraz umożliwia obserwację oczną obrazu.
śruba makrometryczna i śruba mikrometryczna – służą do ustawienia ostrości oglądanego obrazu.
obiektywy – znajdują się w nich soczewki, które powiększają obraz oglądanego przedmiotu.
tarcza rewolweru – poprzez obracanie umożliwia zmianę obiektywu, a co za tym idzie zmianę powiększenia.
źródło światła – podświetla preparat podczas oglądania preparatu.
statyw – usztywnia całą konstrukcję mikroskopu.
Oprócz mikroskopu świetlnego wyróżniamy również inne rodzaje mikroskopów np. elektronowy, konfokalny, fluorescencyjny, akustyczny.
Wyróżniamy dwa rodzaje mikroskopów elektronowych: transmisyjny (TEM) i skaningowy (SEM). Można nim obserwować szczegóły komórki na poziomie atomowym.
Mikroskop konfokalny jest odmianą mikroskopu świetlnego. Można w nim zaobserwować ruch elementów w komórce, dyfuzję, czy interakcję białek.
Mikroskop fluorescencyjny jest bardziej zaawansowanym mikroskopem świetlnym i wykorzystuje on zjawisko fluorescencji. Można nim zaobserwować położenie różnych struktur w komórce np. jądra komórkowego.
Mikroskop akustyczny wykorzystuje fale ultradźwiękowe, co pozwala obserwować nieprzezroczyste składniki komórki.