Obserwacja biologiczna różni się od doświadczenia biologicznego tym, że jest przeprowadzana w naturalnym środowisku, bez wpływu na przebieg obserwowanego zjawiska czy procesu. Doświadczenie przebiega w ściśle kontrolowanych warunkach, ze zmianą jednego czynnika, którego wpływ na organizm czy proces chcemy sprawdzić.
Obserwację biologiczną możesz przeprowadzić za pomocą zmysłów. Natomiast, aby przeprowadzić doświadczenie biologiczne, potrzebujesz warunków laboratoryjnych.