Różnice:
– u roślin okrytonasiennych występują barwne kwiaty, które po zapłodnieniu przekształcają się w owoce z nasionami, natomiast u roślin okrytonasiennych z kwiaty są mniej okazałe, po zapłodnieniu powstają nieosłonięte nasiona,
– u roślin okrytonasiennych występują kwiaty obupłciowe, a u nagonasiennych są osobno kwiatostany męskie i żeńskie,
– rośliny okrytonasienne rozmnażają się płciowo i bezpłciowa, a nagonasienne płciowo.
Podobieństwa:
– występowanie kwiatów,
– występowanie nasion,
– występuje zapylenie i zapłodnienie.
Najbardziej charakterystyczną cechą odróżniającą od siebie nasienne jest wytwarzanie nasion ukrytych wewnątrz owocu przez okrytonasienne i nasion nieosłoniętych przez nagonasienne.