1. Wypłukiwanie z pól uprawnych niewłaściwie stosowanych nawozów.
2. Ścieki przemysłowe i komunalne.
3. Mikrobiologiczne zanieczyszczenia.
Ograniczanie problemu to wyeliminowanie składowania śmieci, kompostu i szeroko pojętych odpadów w pobliżu wodociągów i punktów poboru wody oraz nie wylewanie ścieków na pola czy do naturalnych zbiorników wodnych. W niektórych przypadkach pomocne lub nawet niezbędne może być zastosowanie filtrów wodnych wyłapujących zanieczyszczenia.
