Zalesienie na Pojezierzu Mazurskim jest większe niż średnie zalesienie w Polsce. Na terenie Pojezierza Mazurskiego ponad 80% lasów to lasy iglaste. W związku z licznymi jeziorami charakterystyczne jest występowanie flory wodnej.
Na terenie Pojezierza Wielkopolskiego występują bagna, torfowiska oraz łąki. Większość lasów to łęgi oraz bory sosnowe.
Zlodowacenie Wisły (północnopolskie) objęło obszary północnej i środkowo-zachodniej Polski. Pod lądolodem znalazły się zarówno Pojezierze Mazurskie, jak i Pojezierze Wielkopolskie. Dla Pojezierza Mazurskiego charakterystyczna jest rzeźba młodoglacjalna, w której występują m.in. liczne jeziora. Z terenu dzisiejszego Pojezierza Wielkopolskiego lądolód ustąpił wcześniej, stąd formy polodowcowe zostały już przekształcone, a proces zarastania jezior jest zaawansowany. Teren ten najkrócej był narażony na działanie lądolodu.
Łęgi to lasy liściaste, które występują na terenach okresowo zalewanych. Rzeźba młodoglacjalna określa wyraźne formy rzeźby, pozostałe po ostatnim zlodowaceniu. Charakterystyczne dla rzeźby młodoglacjalnej są takie formy jak: wały moreny czołowej, sandry, ozy, pradoliny, równiny moreny dennej oraz jeziora (morenowe, rynnowe oraz oczka).