Morze Bałtyckie jest mniej zasolone niż Morze Północne, ponieważ nie jest ono bezpośrednio połączone z żadnym z Oceanów (utrudniona wymiana wód), a także wpada do niego wiele rzek, które przyczyniają się do zmniejszenia zasolenia. Co więcej, w obrębie tego zbiornika występuje niewielkie parowanie.
Średnie zasolenie Bałtyku to ok. 7,5‰, z kolei Morza Północnego – od 31 do 35‰.