Według legendy jego rozczłonkowane ciało zrosło się po śmierci. Legenda ta nawiązywała to rozbicia dzielnicowego, miała być zapowiedzią powrotu silnej i zjednoczonej Polski.
Czaszkę św. Stanisława przechowuje się na Wawelu. Nosi ona ślady uderzenia, któremu przypisuje się odpowiedzialność za jego śmierć. Według niektórych historyków to wgłębienie ma dowodzić, że na św. Stanisława dokonano zamachu,