Ekosystemem nazywamy zbiór elementów ożywionych i nieożywionych, które mają na siebie wzajemnie wpływ.
Zbiór wszystkich ożywionych elementów ekosystemu nazywamy biocenozą. Do biocenozy mogą należeć: rośliny, zwierzęta, grzyby, protisty i bakterie.
Zbiór wszystkich nieożywionych elementów ekosystemu nazywamy biotopem. Do biotopu mogą należeć: powietrze, gleba, woda (w różnych stanach skupienia) i skały.