Klimat ma wpływ na różnorodność biologiczną. Na Ziemi największa różnorodność biologiczna występuje na terenach okołorównikowych, ponieważ tamtejszy ciepły i wilgotny klimat pozwala na rozwijanie się bujnej roślinności (producenci), która stanowi schronienie i pożywienie dla organizmów na kolejnych, coraz wyższych poziomach troficznych. Najmniejszą różnorodnością biologiczną cechują się tereny okołobiegunowe, ze względu na skrajnie niskie temperatury, które leżą w zakresie tolerancji ekologicznej bardzo niewielu organizmów żyjących na ziemi.
Różnorodność ekologiczną może kształtować także czynnik, jakim jest wysokość nad poziomem morza. W wysokich partiach gór różnorodność biologiczna maleje, ze względu na specyficzne warunki ciśnienia atmosferycznego.