Zagrożeniami, które wynikają ze współczesnego rolnictwa dla bioróżnorodności to:
1. Masowe wycinanie lasów pod tereny uprawne – wycinka lasów pod tereny uprawne prowadzi do zniszczenia siedlisk dla zwierząt mieszkających w lasach
2. Zarastanie zbiorników wodnych – wynika to z użycia nawozów, które następnie trafiają do zbiorników wodnych
3. Powstawanie monokultur – na polu uprawia się zwykle jeden rodzaj rośliny uprawnej, wszystkie inne rośliny (chwasty) są niepożądane i usuwane za pomocą chemikaliów
4. Opryski – działają szkodliwe nie tylko na chwasty i szkodniki, ale również na inne gatunki takie jak pszczoły.