Stosunek Comte do teologii i metafizyki jest krytyczny. Uważa on, że wraz z upływem czasu człowiek skupia się na rozsądku. Dzięki temu zauważa bezsensowność tego typu rozważań. Dla Comte teologia i metafizyka opierają się na domysłach. Obniża ich rangę, ponieważ nie wykorzystują rozsądku.
Comte twierdzi, że poznanie oparte na rozumie i rozsądku jest bardziej wartościowe niż teologiczne i metafizyczne rozważania wykorzystujące domysły.