Bąkojady oczyszczają skórę dużych kręgowców z pasożytów, dzięki czemu ptaki te mają zapewniony pokarm. Duże kręgowce zyskują na tym oczyszczenie skóry.Kolibry odżywiając się nektarem roślinnym, pomagają w zapylaniu roślin. Rośliny mają zatem pomoc w rozmnażaniu, a kolibry pokarm.
Innymi przykładami protokooperacji, które możemy zauważyć nawet w naszym środowisku, jest współpraca mszyc z mrówkami. Mszyce wydzielają słodki płyn tzw. spadź, którą odżywiają się mrówki. Mrówki natomiast bronią mszyc przed atakiem ze strony biedronek.