Największe zasolenie wód Bałtyku występuje w okolicach Cieśnin Duńskich, gdzie wody Bałtyku mieszają się z bardziej słonymi wodami Morza Północnego.
Zasolenie zmniejsza się, im bardziej na północ i wschód.
Najmniejsze zasolenie Bałtyku zauważalne jest w Zatoce Fińskiej.
Bałtyk jest morze mało słonym, jego średnie zasolenie wynosi 7,5‰, jednak są obszary, gdzie zasolenie wynosi nawet 30‰. Morze Bałtyckie jest morzem słabo zasolonym i stosunkowo mocno zanieczyszczonym. Jego linia brzegowa wynosi ponad 8 tysięcy kilometrów. Bałtyk podzielony jest ze względów naturalnych i praktycznych na strefy administracyjne: Botnik, Basen Gotlandzki, Basen Bornholmski, Morze Bełtów, Kattegat.