Stereoizomeria ma miejsce dla związków nienasyconych, w cząsteczkach których do każdego z atomów węgla przy wiązaniu C=C są przyłączone różne podstawniki. Narysuj wzór półstrukturalny 2-metylobut-2-enalu:
CH3—CH=C(CH3)—CHO
Atom węgla alfa (węgiel obok grupy -CHO) ma dwa różne podstawniki: grupę metylową i grupę aldehydową. Kolejny atom węgla przy wiązaniu C=C również ma dwa różne podstawniki: wodór i grupę metylową, więc tworzy stereoizomery. Izomeria cis-trans to rodzaj izomerii, który wynika z różnego układu podstawników przy wiązaniu wielokrotnym. Izomeria cis (Z) nakazuje umieszczenie atomów tego samego rodzaju „po jednej stronie” (tu chodzi o grupę metylową) – nad lub pod linią wiązania wielokrotnego w przypadku przestawiania wzoru w formie półstrukturalnej. Izomeria trans (E) to ułożenie atomów tego samego rodzaju „po przeciwnych stronach”.