Teoria Daltona jest już nieaktualna, gdyż wiemy, że pierwiastki nie składają się z takich samych atomów. Każdy pierwiastek jest mieszaniną swoich izotopów, czyli atomów o różnych składach jądra; nie są więc one identyczne. Wiemy też, że atomy składają się z jądra i orbitujących wokół niego elektronów, a samo jądro składa się z protonów i neutronów, co podważa stwierdzenie o niepodzielności atomów.
