Sok żołądkowy zawiera kwas solny, który powoduje, że pH żołądka jest bardzo niskie, czyli tworzy bardzo kwasowe środowisko. Takie środowisko jest niesprzyjające dla bakterii i grzybów, nie mogą one w nim przeprowadzać swoich procesów życiowych, dlatego giną, przestając stanowić zagrożenie dla organizmu człowieka.
W błonie śluzowej żołądka znajdują się gruczoły, które wydzielają sok żołądkowy. Błona śluzowa nie tylko jest ważna dla wydzielania soku żołądkowego, ale także chroni ściany żołądka przed jego działaniem. W skład soku żołądkowego wchodzi kwas solny i pepsyna. Kwas solny zapobiega pobranym z pokarmem patogenom, a pepsyna pomaga rozpocząć rozkład białek.