Rolą porów jądrowych jest transport substancji między jądrem komórkowym a cytoplazmą.
Liczba porów jądrowych zależy od aktywności metabolicznej komórki, ponieważ w cytoplazmie podczas biosyntezy białka na mRNA transportowanym z jądra komórkowego powstają enzymy, których obecność jest konieczna do przebiegu procesów metabolicznych.