| Cecha | Komórka eukariotyczna | Komórka prokariotyczna |
| Miejsce występowania DNA | jądro komórkowe | nukleoid |
| Materiał budujący ścianę komórkową | celuloza w komórkach roślinnych lub chityna w komórkach grzybowych | mureina |
| Obecność wici/rzęsek | brak | mogą być obecne |
| Obecność śluzowej otoczki | brak | mogą być obecne |
| Obecność mitochondriów | obecne | brak |
Komórki eukariotyczne różnią się od komórek prokariotycznych jeszcze innymi cechami, np. zawierają otoczone błonami wewnętrznymi organelle komórkowe, obecna jest wakuola, nie posiadają plazmidów.