Genom wirusa i genom bakterii różnią się w następujący sposób:
● Genom wirusa składa się z cząsteczki DNA lub RNA, natomiast genom bakterii jest cząsteczką DNA nazwaną genoforem. Może posiadać również plazmid, czyli dodatkowy materiał genetyczny w formie kolistej cząsteczki DNA.
● Geny w wirusach mogą zachodzić na siebie, w przypadku bakterii jest to niemożliwe.
● Genom wirusów przybiera formę jednoniciową lub dwuniciową, genom bakterii jest zawsze dwuniciowy.
● Genom wirusa ma znacznie mniejsze rozmiary niż genom bakterii. Wirusy składają się czasem tyko z kilku genów i do kilkuset tysięcy par zasad, z kolei genom bakterii może zawierać setki tysięcy lub miliony zasad.
● W genomie wirusa nie odbywają się procesy metaboliczne, natomiast bakteria ma wszystkie geny, które umożliwiają jej wykonywanie czynności życiowych.