Metoda pomiaru fluorescencji chlorofilu umożliwia szybką i czułą ocenę na temat funkcjonowania aparatu fotosyntetycznego, a szczególnie wydajności fotosystemu II i jego możliwości do zaadaptowania się w trudnych warunkach np. w zbyt wysokiej lub niskiej temperaturze, czy w zbyt wysokim lub niskim natężeniu światła.
Czynniki wpływające na przebieg fotosyntezy: