Fitohormony mogą odpowiadać zarówno za spoczynek jak i kiełkowanie nasion.
Inhibitorem kiełkowania jest kwas abscysynowy znajdujący się w nasionach i owocniach. Fitohormon ten hamuje wytwarzanie enzymów, które odpowiadają za hydrolizę substancji zapasowych nasienia.
Fitohormonami stymulującymi kiełkowanie są natomiast gibereliny i cytokininy. Gibereliny odpowiadają za pobudzanie wytwarzania enzymów katalizujących hydrolizę substancji zapasowych nasienia, natomiast razem z cytokininami aktywują wiele enzymów uczestniczących w kiełkowaniu nasion.
Spoczynek bezwzględny, jest to spoczynek głęboki i wynika z braku gotowości nasienia do kiełkowania. Może to wynikać z braku przepuszczalności łupy nasiennej dla wody i gazów, niedojrzałością zarodka czy wpływem inhibitorów wzrostu i rozwoju roślin. O przerwaniu tego stanu decydują czynniki specyficzne dla danego gatunku i uzależniona od przyczyny spoczynku.