Auksyny, które są produkowane w wierzchołku wzrostu pędu hamują rozwój pąków bocznych, czyli odgałęzień łodygi. W dolnej części łodygi ich stężenie jest jednak znacznie mniejsze, dzięki czemu odgałęzienia mogą łatwiej się tworzyć. Efektem takiego działania tego fitohormonu jest charakterystyczny kształt stożka.
Odcięcie pąka wierzchołkowego zmniejsza ilość auksyn w łodydze i powoduje rozwój pąków bocznych. Efektem takiego działania jest rozkrzewienie się rośliny.
Auksyny wytwarzane są w wierzchołkach wzrostu pędów, młodych liściach, pąkach, kwiatach i owocach. Pobudzają one wzrost wydłużeniowy komórek, co pozwala na wzrost i ruchy organów rośliny, stymulują podziały komórkowe kambium, dzięki czemu widoczny jest przyrost łodygi i korzeni na grubość, hamują rozwój pąków bocznych pędu, stymulują powstawanie zawiązków korzeni bocznych i przybyszowych, są przyczyną powstawania tkanki przyrannej, owoców, jak i również hamują zrzucanie liści i owoców.