| Cecha | Fosforylacja cykliczna | Fosforylacja niecykliczna |
| Warunki przebiegu |
|
|
| Udział fotosystemów | udział fotosystemu I | udział obu fotosytemów: I i II |
| Wytwarzanie ATP | tak | tak |
| Wytwarzanie NADPH | nie | tak |
| Uwalnianie się tlenu | nie | tak |
W fosforylacji cyklicznej elektrony, które zapełniają luki elektronowe w fotosystemie I pochodzą z fotosytemu I. Natomiast w fosforylacji niecyklicznej źródłem elektronów zapełniających luki po wybitych elektronach w cząsteczkach chlorofilu w fotosystemie I, jest fotosystem II.