Zakwity wód prowadzą do obniżenia poziomu tlenu w zbiorniku wodnym, co z kolei powoduje wymieranie organizmów w obrębie tego zbiornika. Konsekwencją tego, jest obniżenie się różnorodności biologicznej, co skutkuje zmniejszoną liczebnością gatunków pozyskiwanych/ użytkowanych przez człowieka. Część z sinic wytwarza również toksyny, które są groźne dla zdrowia człowieka
Zakwit wód to zjawisko polegające na masowym występowaniu fitoplanktonu w zbiorniku wodnym, który spowodowany jest wzrostem poziomu substancji organicznych i mineralnych ze ścieków i nawozów produkowanych przez człowieka. Zjawiskom takim można starać się zapobiegać, monitorując stan wód i zmniejszyć napływ substancji z rolnictwa i przemysłu do wód.