Kwaśne opady zakwaszają zbiorniki wodne, skutkuje to m.in. wymieraniem ryb.
Zakwaszenie wody może prowadzić do zaburzenia równowagi biologicznej w zbiorniku wodnym, zabijając bakterie, glony i organizmy wodne, które są istotne dla zdrowia i równowagi ekosystemu. Woda staje się mniej żyzna i niezdolna do podtrzymywania życia dla organizmów wodnych, co może prowadzić do masowego obumierania ryb i innych zwierząt wodnych. Zakwaszenie wody może również zmniejszyć przepuszczalność błony komórkowej, co prowadzi do zaburzenia przepływu składników odżywczych do organizmów wodnych.