Kozakami rejestrowymi nazywano Kozaków, którzy stanowili element armii polskiej i którzy z tego tytułu otrzymywali żołd i służyli władcy Rzeczypospolitej. Nierejestrowymi Kozakami więc pozostawali wszyscy Kozacy, którzy nie pełnili tej służby.
Liczba i zastosowanie Kozaków rejestrowych stanowiło zarzewie licznych sporów na forum sejmu.