Po kapitulacji mjr. Henryk Sucharski został przesłuchany, a następnie internowany i osadzony w obozach jenieckich. Powodem był sukces militarny, jakim można nazwać tak długą obronę oraz pełen posłuch wśród podkomendnych.
Kapitulacja nastąpiła 7 września. W dniach 8-9 września mjr. Henryk Sucharski był przesłuchiwany przez Niemców w Hotelu Centralnym w Gdańsku, a następnie przewieziony do obozu w Stablack. Później, w październiku, przewieziono go do Reisenburgu, aby symbolicznie odebrać mu szpadę. W czasie wojny przebywał w obozach jenieckich Oflag II B w Choszcznie i II D w Bornym Sulinowie. Wyzwolony w lutym 1945 r.