Gatunki wskaźnikowe to organizmy cechujące się wąską tolerancją ekologiczną pod względem czynników środowiskowych. To inaczej bioindykatory, czyli organizmy o niskiej tolerancji względem danego czynnika.
Przykładem mogą być porosty i opracowana na ich podstawie skala porostowa.
Gatunki wskaźnikowe mogą służyć do oceniania stanu środowiska pod względem np. zasolenia, zanieczyszczenia itp.