Elektroforeza umożliwia rozdział odcinków DNA o różnej długości, ponieważ w jej trakcie odcinki o różnej długości rozchodzą się z odmienną prędkością w żelu.
Krótsze odcinki przemieszczają się łatwiej i szybciej, co sprawia, że docierają dalej niż dłuższe odcinki.
