Organizmy zmodyfikowane genetycznie mogą być wykorzystywane w ochronie środowiska. To na przykład bakterie rozkładające ropę naftową, które w przypadku zanieczyszczenia wód okazują się bardzo pomocne.
Ciekawym zastosowaniem są też biopaliwa z odpadków lignocelulozowych, nad którymi wciąż trwają badania. Takie biopaliwa to cenna alternatywa w przyszłości ograniczająca emisję dwutlenku węgla.
Lignoceluloza jest głównym składnikiem biomasy roślinnej.