Komisja Edukacji Narodowej podporządkowywała sobie wszystkie szkoły w Rzeczpospolitej. Zaczęto kłaść nacisk na wiedzę praktyczną oraz wychowanie patriotyczne. Zmieniono też język nauczania z łaciny na polszczyznę. W celu stworzenia aktualnych podręczników stworzono nową instytucję – Towarzystwo do Ksiąg Elementarnych.
Pieniądze potrzebne do stworzenia Komisji przejęto ze skasowanego przez papieża zakonu jezuitów.