Mutacja odpowiedzialna za wystąpienie choroby Huntingtona skutkuje wstawieniem dodatkowych aminokwasów - glutaminy w pierwszorzędowej strukturze białka Htt.
Struktura I-rzędowa: sekwencja aminokwasów w białku.
Struktura II-rzędowa: to łańcuchy polipeptydowe tworzące strukturę α-helisy lub β-harmonijki.
Struktura III-rzędowa: określa kształt białka, powstaje w wyniku przestrzennego pofałdowania łańcucha polipeptydowego, zniszczenie tej struktury w wyniku denaturacji powoduje utratę aktywności białka.
Struktura IV-rzędowa: powstaje w wyniku połączenia kilku podjednostek białka, które mają strukturę III-rzędową.
Sekwencja aminokwasów w białku tworzy strukturę I-rzędową, wpływa na funkcje i metabolizm białka. Zmiana nawet jednego aminokwasu na inny może zmienić ogólną strukturę białka, co spowoduje, że nie będzie ono pełniło swoich docelowych w danym miejscu organizmu funkcji.