Mutacje dzielimy na:
· punktowe, które dotyczą pojedynczych nukleotydów,
· chromosomowe, które dotyczą struktury lub liczby chromosomów.
W przypadku mutacji punktowych może dojść do wypadnięcia nukleotydu (delecja), zmiany nukleotydu na inny (translokacja) lub wstawienia dodatkowego nukleotydu (insercja).