Wirusy i bakterie chorobotwórcze mogą wywołać reakcje zapalne, uszkodzić tkanki, zaburzyć funkcjonowanie narządów, co ma duży wpływ na homeostazę organizmu.
Infekcje zazwyczaj wywołują odpowiedź układu odpornościowego, np. w przypadku infekcji wirusowej układu oddechowego pojawiają się utrudnienia w oddychaniu, co wpływa na równowagę wymiany gazowej organizmu. Infekcje mogą prowadzić do uszkodzenia tkanek i w konsekwencji zaburzają prawidłowe ich funkcjonowanie, np. bakterie E. coli wywołują biegunkę i odwodnienie organizmu, co zaburza równowagę elektrolitową.