Zarówno alchemia, jak i jatrochemia zajmują się odkrywaniem leków. Alchemicy mieli wspólny cel – odkryć sposób na przetransmutowanie ołowiu w czyste złoto (legendarny kamień filozoficzny), utworzenie leku, który zwalczy każdą chorobę (panaceum), a także eliksiru nieśmiertelności. Natomiast jatrochemii przyświecał głównie jeden cel – odkrywanie coraz to nowszych i skuteczniejszych leków. Sztampowym przedstawicielem i propagatorem jatrochemii był Paracelsus. Dzięki niemu pojawiły się w leczeniu chorób: alkohol, miedź, sole arsenu, ołów i srebro, a także wymyślił reguły dawkowania leków.
