– bakterie pasożytnicze, które czerpią pokarm od innych organizmów, powodując u nich ciężkie choroby.
– bakterie symbiotyczne żyjące wewnątrz lub na powierzchni innego organizmu, gdzie oba organizmy odnoszą korzyść ze współdziałania, korzystając z wzajemnie wytwarzanych substancji.
– bakterie gnilne, które odżywiają się martwą materią.
Nieliczne bakterie odżywiają się autotroficznie:
– bakterie fotosyntetyzujące
– bakterie chemosyntetyzujące, które czerpią energię z utleniania związków nieorganicznych.
Do bakterii fotosyntetyzujących należą sinice oraz zielone i purpurowe bakterie siarkowe i bezsiarkowe, a wśród bakterii chemosyntetyzujących, czyli takich, które energię czerpią z utleniania związków nieorganicznych, wyróżniamy bakterie nitryfikacyjne, siarkowe, wodorowe i żelazowe.