Ewolucji podlegają: gatunek, populacja niebędąca w stanie równowagi, rodzina oraz rodzaj.
Odpowiedź na to pytanie nie jest jednak jednoznaczna. Ewolucji na pewno podlega gatunek – występujące zjawiska specjacji (powstawania nowego gatunku), anagenezy (zmiany zachodzące w obrębie gatunku / całej populacji) oraz wymieranie gatunków świadczą o zachodzącej ewolucji.
Populacja również może podlegać ewolucji, jednakże, jeśli populacja znajduje się w stanie równowagi (częstotliwość występowania alleli konkretnych genów nie zmienia się), to taka populacja nie podlega ewolucji.
Rodzina oraz rodzaj znajdują się nad gatunkiem w hierarchii taksonomicznej. Na przykład: do rodziny psowatych należą wilki, lisy, psy. Nazwy wilk, pies oraz lis to rodzaje. Gatunkiem określimy natomiast psa domowego lub lisa rudego.
Obecne mówi się, że ewolucja biologiczna zachodzi na każdym szczeblu organizacji biologicznej. Dlatego ewolucji może podlegać gatunek, rodzaj, rodzina oraz populacja.