Korzenie są bardziej wrażliwe na auksyny niż łodygi. Niewielkie stężenia auksyn pobudzają wzrost korzenia, natomiast wyższe mogą go hamować. Łodyga do pobudzenia wzrostu wymaga większego stężenia auksyn.
Optymalne stężenie auksyn jest inne dla różnych organów. Stężenie korzystne dla wzrostu łodygi może być już zbyt wysokie dla korzenia i hamować wydłużanie jego komórek.