Rozdzielczość mikroskopu wykorzystującego promienie ultrafioletowe jest lepsza niż w przypadku zwykłego mikroskopu, który jest przystosowany do zwykłego światła, ponieważ promienie UV mają krótszą długość niż światło widzialne, co pozwala na mniejsze rozpraszanie światła. Krótsza długość fali pozwala także do dostrzeżenia większej ilość mniejszych detali. Ponadto promieniowanie UV ma wyższą energię fotonów, dzięki czemu powstałe obrazy są wyraźniejsze.
Pomimo większej rozdzielczości, mikroskopy UV nie są wystarczające do obserwacji wirusów, ponieważ rozmiary wirusów są znacznie mniejsze od długości fali promieniowania nadfioletowego, przez co nie są one w stanie pomóc w ich zauważeniu. Przykładowo mikroskopy elektronowe, które wykorzystują wiązki elektronów zamiast światła, mogą pokazać wirusy, ponieważ uzyskują bardzo wysoką rozdzielczość dzięki zastosowaniu elektronów.
